Ekonomický úsek VFN zajišťuje ekonomické řízení VFN, určuje zásady finanční, ekonomické, daňové politiky, tvorby rozpočtů a plánů, jejich zpracování a vyhodnocení, odpovídá za vedení účetnictví a výkaznictví dle platných zákonů, správné vykazování majetku, sestavuje rozbory hospodaření VFN s vyhodnocením a následným řešením. Dále tvoří smluvní politiku ve vztahu ke zdravotným pojišťovnám a následně aplikuje při vyúčtování těchto služeb.