Kliniky, ústavy

• Centrum primární péče
• Centrum pro cévní přístupy
• Denní sanatorium Horní Palata
• Dermatovenerologická klinika
• Fakultní transfuzní oddělení
• Foniatrická klinika
• I. chirurgická klinika – břišní, hrudní a úrazové chirurgie
• I. interní klinika – klinika hematologie
• I. klinika tuberkulózy a respiračních nemocí
• II. chirurgická klinika – kardiovaskulární chirurgie
• II. interní klinika – klinika kardiologie a angiologie
• III. interní klinika – klinika endokrinologie a metabolismu
• IV. interní klinika – klinika gastroenterologie a hepatologie
• Kardionefrologické centrum
• Klinika adiktologie
• Klinika anesteziologie, resuscitace a intenzivní medicíny (KARIM)
• Klinika geriatrie a interní medicíny
• Klinika gynekologie, porodnictví a neonatologie
• Klinika nefrologie
• Klinika paliativní medicíny
• Klinika pediatrie a dědičných poruch metabolismu
• Klinika pracovního lékařství
• Klinika rehabilitačního lékařství
• Komplexní kardiovaskulární centrum (KKVC)
• Lůžka včasné rehabilitace iktového centra
• Neurologická klinika
• Oční klinika
• Oddělení otorinolaryngologie (ORL)
• Onkologická klinika
• Psychiatrická klinika
• Radiodiagnostická klinika
• Sexuologický ústav
• Společný příjem interně nemocných (SPIN)
• Stomatologická klinika
• Urologická klinika
• Ústav biologie a lékařské genetiky
• Ústav klinické imunologie a alergologie
• Ústav lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky
• Ústav nukleární medicíny
• Ústav patologie
• Ústav soudního lékařství a toxikologie – soudní lékařství
• Ústav soudního lékařství a toxikologie – toxikologie
• Ústav tělovýchovného lékařství